ตัวอย่างที่ซับซ้อน? เครื่องอัลตราโซนิกแบบครบวงจรสําหรับการสกัดดีเอ็นเอ

เครื่องอัลตราโซนิกสําหรับการสกัดดีเอ็นเอจะรวมพลังงานเสียงความถี่สูงไว้ในสภาพแวดล้อมจุลภาคที่ปิดสนิท มันสลายเซลล์และปล่อยกรดนิวคลีอิกในสภาพแวดล้อมที่ปิดสนิทและไม่สัมผัสในขณะที่ควบคุมอุณหภูมิอย่างเข้มงวดเพื่อรักษาความสมบูรณ์ของดีเอ็นเอ เมื่อจําเป็น สามารถใช้การควบคุมการเปิดรับแสงเสียงสําหรับการกระจายตัวปลายน้ําได้ รองรับเมทริกซ์ที่แตกต่างกัน หนืด หรือชีวมวลต่ํา อะไรช่วยให้สามารถควบคุมและทําซ้ําได้ และจะสร้างมาตรฐานเวิร์กโฟลว์ของคุณได้อย่างไร รายละเอียดและหลักฐานตามมา

คืออะไร an เครื่องอัลตราโซนิก fหรือการสกัดดีเอ็นเอ?

เครื่องอัลตราโซนิกสําหรับการสกัดดีเอ็นเอเป็นระบบอะคูสติกที่โฟกัสซึ่งเน้นเสียงความถี่สูงความยาวคลื่นสั้นลงในโซนตัวอย่างที่กําหนดไว้อย่างแน่นหนา แทนที่จะจุ่มโพรบโลหะหรือพึ่งพาอ่างทั่วไป เครื่องมือจะส่งพลังงานผ่านสื่ออะคูสติกโดยไม่ต้องสัมผัสตัวอย่าง การกําจัดการสัมผัสโดยตรงจะช่วยลดความเสี่ยงในการปนเปื้อน หลีกเลี่ยงการเกิดละอองลอย และควบคุมสิ่งประดิษฐ์ที่ขับเคลื่อนด้วยความร้อนซึ่งสามารถบิดเบือนโปรไฟล์ชิ้นส่วนได้

ที่ Longlight Technology เราใช้รูปทรงเรขาคณิตอะคูสติกที่มุ่งเน้นเพื่อรักษาสภาพแวดล้อมที่เสถียรและใกล้เคียงกับความร้อนสูงในระหว่างการประมวลผล ตัวอย่างยังคงปิดผนึกในหลอดปิดในขณะที่พลังงานอัลตราโซนิกที่วัดได้อย่างแม่นยําจะแยกส่วน DNA หรือขัดขวางเซลล์และเนื้อเยื่อ วิธีการแบบไม่สัมผัสแบบท่อปิดนี้ทําให้เกิดการกระจายขนาดชิ้นส่วนที่แคบอย่างสม่ําเสมอและการกู้คืนที่เสถียรตลอดการวิ่ง มันเปล่งประกายด้วยเมทริกซ์ที่ท้าทาย - ไบโอฟิล์ม, ตัวอย่างทางคลินิกที่มีความหนืด, เนื้อเยื่อที่ผ่านการบําบัดด้วยฟอร์มาลิน - ซึ่งโพรบแบบเดิมหรือการ sonication ในอ่างน้ํามักจะแตกต่างกันอย่างมาก ในระยะสั้นเครื่องอัลตราโซนิกที่ทันสมัยสําหรับการสกัดดีเอ็นเอรวมอะคูสติกที่นุ่มนวลและควบคุมได้อย่างแม่นยําด้วยความสม่ําเสมอที่แข็งแกร่งทําให้ประสบความสําเร็จในขั้นตอนจีโนมิกส์และโปรตีโอมิกส์

การวิจัยระดับโลก aและกรณีการใช้งานที่ได้รับการพิสูจน์แล้ว

อัลตราโซนิกที่มุ่งเน้นมีประวัติที่ลึกซึ้งในการจัดลําดับรุ่นต่อไป (NGS) ชีววิทยาโครมาตินและไปป์ไลน์ ID จุลินทรีย์ เป็นแกนนําสําหรับการกระจายตัวของ DNA ในการสร้างห้องสมุดและสําหรับการตัดโครมาตินใน ChIP-Seq และการทดสอบที่เกี่ยวข้อง

•นักวิจัยเช่น Elaine R. Mardis (ศูนย์จีโนมมหาวิทยาลัยวอชิงตัน) และ Jay Shendure (มหาวิทยาลัยวอชิงตัน) ได้ให้รายละเอียดโปรโตคอลการตัดอะคูสติกแบบท่อปิดสําหรับไลบรารี NGS โดยเน้นการกระจายชิ้นส่วนที่แน่นหนา การสูญเสียตัวอย่างต่ํา และความสามารถในการทําซ้ําที่ดีขึ้นเมื่อเทียบกับวิธีการที่ใช้โพรบ

(Elaine R. Mardis และ Jay Shendure, 2010, ความหลากหลายของการเปลี่ยนแปลงจํานวนสําเนาของมนุษย์และยีนหลายสําเนา)

•ทีมงานที่มีปริมาณงานสูงรวมถึง Broad Institute และ ENCODE Consortium อธิบายการกระจายตัวของ DNA ตาม sonication และการหยุดชะงักของโครมาตินในวิธีการที่ตีพิมพ์โดยเน้นย้ําถึงการยอมรับอย่างกว้างขวางของอะคูสติกที่มุ่งเน้นในสภาพแวดล้อมที่มีการควบคุม

(เกี่ยวกับข้อมูล ENCODE ที่ UCSC)

•ทีมจุลชีววิทยาคลินิกที่ใช้ MALDI-TOF MS ขึ้นอยู่กับอัลตราโซนิกที่ปรับให้เหมาะสมเพื่อสลายสิ่งมีชีวิตที่ยืดหยุ่น - เชื้อราเส้นใย Mycobacterium - ให้ไลเสทสม่ําเสมอที่เพิ่มสัญญาณสเปกตรัมต่อสัญญาณรบกวนและเพิ่มความแม่นยําในการระบุตัวตน

(MALDI-TOF MS Mycobacterium Speciation | การเกิดสปีชีส์ ราคาทดสอบในเดลี | การวินิจฉัยพระพิฆเนศ)

•ห้องปฏิบัติการจุลพยาธิวิทยาใช้อะคูสติกที่มุ่งเน้นมากขึ้นเพื่อ deparaffinize ส่วน FFPE และกู้คืนกรดนิวคลีอิกภายใต้สภาวะอุณหภูมิต่ํารักษาความสมบูรณ์สําหรับ PCR การจัดลําดับและการสร้างโปรไฟล์โปรตีน

(การสกัด FFPE | โควาริส)

เมื่อรวมกันแล้วตัวอย่างเหล่านี้แสดงให้เห็นว่าเครื่องอัลตราโซนิกสําหรับการสกัดดีเอ็นเอช่วยให้วิธีการที่ได้มาตรฐานและตรวจสอบย้อนกลับได้ในโปรแกรมหลายไซต์ในขณะที่ลดความแปรปรวนด้วยตนเองและการดริฟท์ข้ามตัวดําเนินการ

ลองไลท์'เอส วัน-หยุดอัลตราโซนิก: ออกแบบ aข้อดี

เครื่องอัลตราโซนิกสําหรับการสกัดดีเอ็นเอได้รับการออกแบบมาเพื่อปล่อยดีเอ็นเออย่างมีประสิทธิภาพโดยไม่มีการกระจายตัวมากเกินไปโดยไม่ได้ตั้งใจ การกระจายตัวจะถูกนําไปใช้เฉพาะเมื่อเวิร์กโฟลว์ต้องการอย่างชัดเจนเท่านั้น ในฐานะผู้ผลิต Longlight Technology ออกแบบเพื่อผลลัพธ์เดียว: ข้อมูลที่ทําซ้ําได้จากตัวอย่างที่ซับซ้อนโดยใช้ความพยายามของผู้ปฏิบัติงานน้อยที่สุด ของเรา หนึ่ง-หยุดเครื่องอัลตราโซนิกสําหรับการสกัดดีเอ็นเอ รวมปริมาณงานแบบหลายช่องสัญญาณ การจัดการอุณหภูมิแบบแอคทีฟ และการตรวจสอบย้อนกลับข้อมูลเต็มรูปแบบในระบบขนาดกะทัดรัดที่เป็นมิตรกับม้านั่งที่ออกแบบมาสําหรับการใช้งานประจําวัน

ปริมาณงานที่ยืดหยุ่นเริ่มต้นด้วย 16 ตําแหน่งหลุม ประมวลผลตัวอย่างที่สําคัญเพียงตัวอย่างเดียวหรือชั้นวางเต็ม 16 ตัวอย่างในเซสชันเดียว แต่ละตําแหน่งสามารถเรียกใช้โปรไฟล์อะคูสติกอิสระ - รอบการทํางาน ความหนาแน่นของพลังงาน การเปิดรับแสงทั้งหมด - เพื่อให้คุณสามารถปรับแต่งการตั้งค่าให้เข้ากับองค์ประกอบของตัวอย่างได้ สําหรับเมทริกซ์ปกติ โหมดแบทช์ช่วยให้คุณป้อนพารามิเตอร์เพียงครั้งเดียวและดําเนินการประมวลผลในคลิกเดียวสําหรับตัวอย่างที่คล้ายคลึงกันทั้งหมด ซึ่งช่วยลดเวลาในการตั้งค่าและข้อผิดพลาด

•การประมวลผลแบบไม่สัมผัส: อัลตราซาวนด์ถูกควบคู่กันผ่านเส้นทางของไหลโดยไม่ต้องสัมผัสตัวอย่างโดยตรงลดการปนเปื้อนข้ามการก่อตัวของละอองลอยและการพกพา

•การควบคุมอุณหภูมิต่ําที่เสถียร: การตรวจจับที่มีความแม่นยําสูงและการป้อนกลับแบบวงปิดช่วยให้ซองจดหมายระบายความร้อนแน่นรักษาความสมบูรณ์ของ DNA และ จํากัด อคติที่เกิดจากความร้อนระหว่างการตัดหรือการสลาย

•การทํางานที่เงียบ: วิศวกรรมการลดเสียงรบกวนช่วยขจัดข้อกําหนดสําหรับกล่องหุ้มเสียงขนาดใหญ่ เหมาะอย่างยิ่งสําหรับแกนที่ใช้ร่วมกันและการตั้งค่าม้านั่งทั่วไป

•การตรวจสอบย้อนกลับแบบ end-to-end: การจับพารามิเตอร์การเรียกใช้การประทับเวลาและเอาต์พุตข้อมูลโดยอัตโนมัติรองรับการตรวจสอบโปรแกรมการฝึกอบรมและการยืนยันวิธีการข้ามกลุ่ม

•การระบายน้ําอัตโนมัติ: การล้างของเสียอัตโนมัติด้วยการสัมผัสพร้อมการตรวจจับระดับและการแจ้งเตือนการล้นล่วงหน้าช่วยลดภาระการบํารุงรักษาและจํากัดการสัมผัส

•ระบบปฏิบัติการแบบบูรณาการ: ระบบปฏิบัติการแบบฝังตัวจะกําจัดพีซีภายนอกลดขนาดการตั้งค่าและเปิดใช้งานการปรับใช้อย่างรวดเร็วในพื้นที่ห้องปฏิบัติการที่มีข้อจํากัด

โครงร่างคอนโฟกัสจะนําพลังงานอย่างแม่นยํา ระงับการสูญเสียเข้าสู่ตัวกลางที่มีเพศสัมพันธ์ และให้การควบคุมการสัมผัสที่เข้มงวดยิ่งขึ้น หน่วยได้รับการปรับเทียบจากโรงงานกับการอ้างอิงเพื่อมอบประสิทธิภาพที่สม่ําเสมอ ซึ่งมีความสําคัญอย่างยิ่งสําหรับการศึกษาหลายไซต์และเวิร์กโฟลว์ที่มีการควบคุมที่ต้องการการเปรียบเทียบ

โปรแกรม ประยุกต์ and จุดบกพร่องของอุตสาหกรรมที่เราแก้ไข

ตัวอย่างที่ซับซ้อนสามารถเปิดเผยขีด จํากัด ของวิธีการ sonication แบบเก่าได้อย่างรวดเร็ว ระบบโพรบสามารถนําสารปนเปื้อน สร้างละอองลอย และส่งพลังงานจากหลอดหนึ่งไปยังอีกหลอดหนึ่งไม่สม่ําเสมอ อ่างน้ําทั่วไปอาจทําให้ตัวอย่างร้อนขึ้นอย่างคาดเดาไม่ได้ ปริมาณงานเป็นอีกหนึ่งคอขวด: ห้องปฏิบัติการมักเลือกระหว่างความแม่นยําของท่อเดียวและประสิทธิภาพของแบทช์

เครื่องอัลตราโซนิกสําหรับการสกัดดีเอ็นเอจากเทคโนโลยี Longlight จัดการกับข้อจํากัดเหล่านี้ด้วยอะคูสติกที่แม่นยําและไม่สัมผัส ช่องสัญญาณอิสระสําหรับการปรับแต่งต่อตัวอย่าง และการวิ่งที่ตรวจสอบย้อนกลับได้อย่างสมบูรณ์

•การกระจายตัวของจีโนมใน NGS: สร้างการกระจายชิ้นส่วนที่แน่นและกําหนดเป้าหมายได้ - แม้กระทั่งจาก gDNA ที่มีเมกะวัตต์สูง - เพื่อเพิ่มความซับซ้อนของไลบรารีและลดความต้องการในการเลือกขนาด

•การกระจายตัวของโครมาตินและการสลายตัวของเซลล์ / เนื้อเยื่อ: ใช้การควบคุมความร้อนอย่างเข้มงวดในระหว่างการสลายและการกระจายตัวเพื่อปกป้อง epitopes และทําให้โปรตีน - DNA คอมเพล็กซ์คงที่สําหรับการสร้างโปรไฟล์โอมิกส์ปลายน้ํา

•การกําจัดพาราฟิน FFPE: การกําจัดพาราฟินด้วยความร้อนต่ําที่ช่วยเพิ่มความสมบูรณ์ของกรดนิวคลีอิกและโปรตีนสําหรับการจัดลําดับและการใช้อิมมูโนแอสเซย์

•การเตรียม MALDI-TOF MS: กําหนดมาตรฐานเวิร์กโฟลว์การสลายสําหรับเชื้อราเส้นใยและ Mycobacterium เพื่อเพิ่มความคมชัดของมวลสเปกตรัมและเพิ่มความมั่นใจในการเรียกระดับสายพันธุ์

•การทําให้เป็นเนื้อเดียวกันของเนื้อเยื่อชีวภาพ: ผลิตสารแขวนลอยที่สม่ําเสมอโดยไม่ต้องสัมผัสทางกลโดยตรงทําให้สามารถสกัด RNA / DNA และโปรตีโอมิกส์ได้สะอาดขึ้นโดยมีสิ่งประดิษฐ์น้อยลง

การตรวจสอบย้อนกลับและความปลอดภัยเป็นมาตรฐาน เรียกใช้ข้อมูลเมตาและผลลัพธ์จะถูกบันทึกไว้สําหรับเส้นทางการตรวจสอบ การตรวจจับการระบายน้ําอัตโนมัติและน้ําล้นช่วยเพิ่มความคล่องตัวในการปฏิบัติตามข้อกําหนดลดเวลาในการสัมผัสของผู้ปฏิบัติงานและทําให้ม้านั่งเป็นระเบียบเรียบร้อย การทํางานที่มีเสียงรบกวนต่ําเหมาะกับสภาพแวดล้อมที่ใช้ร่วมกันโดยไม่ต้องมีกล่องหุ้มหรือโครงสร้างพื้นฐานเพิ่มเติม

การนําไปใช้ การประกันคุณภาพ and โทร tการกระทํา

การปรับใช้เครื่องอัลตราโซนิกแบบครบวงจรของเราสําหรับการสกัดดีเอ็นเอนั้นตรงไปตรงมา เริ่มต้นด้วยนักบินที่ตรงกับส่วนผสมตัวอย่างของคุณ รวมถึงวัสดุที่มีความหนืด ชีวมวลต่ํา หรือ FFPE ใช้การปรับต่อหลุมสําหรับค่าผิดปกติและโหมดแบทช์สําหรับชุดกิจวัตร ตรวจสอบความถูกต้องด้วยมาตรฐาน QC ของคุณ - การปรับขนาดไมโครฟลูอิดิก อิเล็กโทรโฟรีซิสของเส้นเลือดฝอย หรือผลผลิต qPCR - เพื่อตรวจสอบโปรไฟล์ชิ้นส่วนและการกู้คืน จากนั้นล็อคเทมเพลตวิธีการเพื่อให้การรันในอนาคตทําได้เพียงคลิกเดียว สามารถตรวจสอบย้อนกลับได้อย่างสมบูรณ์ และสอดคล้องกันระหว่างผู้ปฏิบัติงานและกะ

• ความสามารถหลัก fหรือตัวอย่างที่ซับซ้อน

•ประมวลผล 1 - 16 ตัวอย่างต่อเซสชัน ผสมโปรไฟล์ต่อหลุมแบบกําหนดเองกับโปรไฟล์แบทช์ตามต้องการ

•รักษาสภาพแวดล้อมไอโซเทอร์มอลที่มีการควบคุมอย่างเข้มงวดด้วยเซ็นเซอร์ความไวสูงเพื่อปกป้องคุณภาพดีเอ็นเอ

•ทํางานอย่างเงียบ ๆ ในพื้นที่ห้องปฏิบัติการมาตรฐาน ไม่จําเป็นต้องใช้พีซีภายนอกหรือกล่องหุ้มเสียง

•ดึงข้อมูลการวิ่งที่สมบูรณ์และเส้นทางการตรวจสอบเพื่อสนับสนุนการฝึกอบรมการติดตามความสามารถในการทําซ้ําและการปฏิบัติตามข้อกําหนด

เริ่มต้นด้วย a นักบิน

เราแนะนําให้ทําการศึกษาความเป็นไปได้สั้น ๆ โดยใช้ตัวอย่างทั่วไปของคุณ เช่น เมทริกซ์หนืด ตัวอย่างอินพุตต่ํา หรือส่วน FFPE เพื่อให้ทีมแอปพลิเคชันของเราสามารถแมปการตั้งค่าเสียงกับเป้าหมายของคุณได้ ซึ่งช่วยลดเวลาในการตรวจสอบ เร่งการสร้าง SOP และลดความยุ่งยากในการถ่ายโอนไปยังการดําเนินการที่มีการควบคุมหรือปริมาณงานสูง

เทคโนโลยี Longlight มีเครื่องมือวัด โปรโตคอล และการสนับสนุนเพื่อให้การเตรียมตัวอย่างที่ซับซ้อนสามารถคาดการณ์และทําซ้ําได้ เครื่องอัลตราโซนิกของเราสําหรับการสกัดดีเอ็นเอให้การประมวลผลแบบไม่สัมผัสการควบคุมอุณหภูมิต่ําที่แท้จริงการทํางานที่เงียบเวิร์กโฟลว์ที่ตรวจสอบย้อนกลับได้และทั้งแบทช์และแบบกําหนดเอง - เสริมด้วยการระบายน้ําอัตโนมัติและระบบปฏิบัติการแบบบูรณาการ

คํากระตุ้นการตัดสินใจ

พร้อมที่จะสร้างมาตรฐานเวิร์กโฟลว์ DNA ของคุณแล้วหรือยัง? ส่งอีเมลถึง Longlight Technology เพื่อขอการสาธิต ส่งตัวอย่างทดสอบเพื่อตรวจสอบคุณสมบัติ หรือนัดหมายการให้คําปรึกษาเกี่ยวกับโปรโตคอล จัดเตรียมทีมของคุณด้วยเครื่องอัลตราโซนิกแบบครบวงจรสําหรับการสกัดดีเอ็นเอที่สร้างขึ้นสําหรับตัวอย่างที่ซับซ้อนและความสามารถในการทําซ้ําที่เชื่อถือได้