เหตุใด XL-MS จึงเร่งการค้นพบเป้าหมายของยา

การค้นพบเป้าหมายยาเป็นกระบวนการค้นหาโมเลกุลเฉพาะในร่างกายที่ยาใหม่ควรออกฤทธิ์ การรักษามะเร็งที่ประสบความสําเร็จ สารยับยั้งไคเนสหลายชนิด และยาจุดตรวจภูมิคุ้มกัน เช่น แอนติบอดี PD-1/PD-L1 ล้วนเริ่มต้นด้วยความก้าวหน้าของ Drug Target Discovery นักวิจัยมองหาโปรตีนที่ขับเคลื่อนโรคตรวจสอบบทบาทของพวกมันจากนั้นออกแบบโมเลกุลขนาดเล็กหรือชีววิทยาเพื่อปรับพวกมัน วิธีการแบบดั้งเดิมมักจะพยายามเปิดเผยเป้าหมายที่ถูกต้องในเวลาที่เหมาะสม เราจะเห็นปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนได้ชัดเจนยิ่งขึ้นในสภาพแวดล้อมทางชีวภาพจริง และย้ายจากผู้สมัครไปยังเป้าหมายที่ได้รับการยืนยันได้เร็วขึ้นได้อย่างไร นี่คือจุดที่ XL-MS เริ่มเปลี่ยนเกม...

(สารยับยั้งจุดตรวจภูมิคุ้มกัน – NCI)

การดูเป้าหมายยาเสพติด ผมn เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ที่แท้จริงของพวกเขา

XL-MS (แมสสเปกโตรเมตรีเชื่อมขวาง) เริ่มต้นจากแนวคิดง่ายๆ: หากโปรตีนสองตัวอยู่ใกล้กันมากพอตัวเชื่อมขวางสามารถล็อคเข้าด้วยกันได้ เมื่อเกิดการเชื่อมโยงนั้นแล้ว แมสสเปกโตรเมตรีสามารถตรวจจับเปปไทด์ที่เชื่อมขวางและแสดงให้คุณเห็นว่าบริเวณใดของโปรตีนที่เกี่ยวข้อง

ในทางปฏิบัติ หมายความว่าคุณสามารถเพิ่มสารเชื่อมขวางไปยังเซลล์ไลเสทหรือคอมเพล็กซ์บริสุทธิ์ได้โดยตรง รีเอเจนต์เหล่านี้สร้างพันธะโควาเลนต์ระหว่างกรดอะมิโนที่อยู่ใกล้เคียง ซึ่ง "แช่แข็ง" โปรตีน – ปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนอย่างมีประสิทธิภาพ สิ่งสําคัญคือสิ่งนี้รวมถึงปฏิสัมพันธ์ที่อ่อนแอชั่วคราวหรือขึ้นอยู่กับเงื่อนไขซึ่งมักจะหายไประหว่างขั้นตอนการทําให้บริสุทธิ์หรือการซัก

สําหรับ Drug Target Discovery ระดับของรายละเอียดนั้นมีค่าอย่างยิ่ง เป้าหมายยาส่วนใหญ่ทํางานภายในคอมเพล็กซ์โปรตีนหลายชนิดขนาดใหญ่หรือเส้นทางการส่งสัญญาณ หากคุณรู้โครงสร้างของโปรตีนเพียงตัวเดียว คุณจะเห็นเพียงส่วนหนึ่งของเรื่องราว ด้วย XL-MS คุณสามารถ:

•ทําแผนที่โปรตีนที่มีปฏิสัมพันธ์โดยตรงกับเป้าหมายของคุณ

•ค้นหาไซต์หรือโดเมนที่มีผลผูกพันโดยประมาณที่เกี่ยวข้องกับการโต้ตอบ

•เปรียบเทียบรูปแบบปฏิสัมพันธ์ระหว่างตัวอย่างที่มีสุขภาพดีและตัวอย่างโรค

•ติดตามว่าสารประกอบของผู้สมัครอาจขัดขวางหรือทําให้ผู้ติดต่อเฉพาะมีเสถียรภาพอย่างไร

XL-MS ยังเข้ากันได้ดีกับวิธีการโครงสร้าง เช่น cryo-EM และผลึกเอ็กซ์เรย์ ชีววิทยาโครงสร้างให้สแนปช็อตความละเอียดสูงแก่คุณ XL-MS เพิ่มการจํากัดระยะทางและรูปแบบการโต้ตอบที่ช่วยตรวจสอบหรือปรับแต่งโมเดล โดยเฉพาะอย่างยิ่งสําหรับพื้นที่ที่ยืดหยุ่นซึ่งยากต่อการแก้ไข เมื่อรวมกันแล้วพวกเขาให้ภาพที่สมจริงยิ่งขึ้นว่าเป้าหมายยาของคุณมีพฤติกรรมอย่างไรในสภาพแวดล้อมระดับโมเลกุลที่แออัด

เหตุใด XL-MS จึงเหมาะกับไปป์ไลน์การค้นพบเป้าหมายยาสมัยใหม่

หลายทีมบอกเราในสิ่งเดียวกัน: พวกเขาต้องการข้อมูลเชิงลึกที่ลึกซึ้งยิ่งขึ้นเกี่ยวกับปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน แต่พวกเขาไม่สามารถซื้อวิธีการที่ทําให้โปรแกรมทั้งหมดช้าลงได้ XL-MS มีความน่าสนใจเพราะให้ข้อมูลทางชีวภาพที่หลากหลายโดยไม่ต้องออกแบบเวิร์กโฟลว์ของคุณใหม่ทั้งหมด

ข้อได้เปรียบในทางปฏิบัติบางประการที่โดดเด่นในโครงการประจําวัน:

•ปริมาณงานสูงเนื้อหาข้อมูลสูง

XL-MS เหมาะอย่างยิ่งสําหรับตัวอย่างที่ซับซ้อนและการศึกษาขนาดใหญ่ เมื่อการเชื่อมขวางและการย่อยสลายได้รับการปรับให้เหมาะสมแล้ว แมสสเปกโตรมิเตอร์ขั้นสูงจะสามารถจัดการกับตัวอย่างจํานวนมากได้ในครั้งเดียว การประมวลผลข้อมูลอัตโนมัติจะเปลี่ยนสเปกตรัมดิบให้เป็นแผนที่ปฏิสัมพันธ์ ซึ่งช่วยให้ทีมของคุณเปลี่ยนจากการทดลองไปสู่การตีความได้เร็วขึ้น

•ทํางานในสภาพพื้นเมืองมากขึ้น

เนื่องจากการเชื่อมขวางสามารถทําได้ในสภาพแวดล้อมของเซลล์หรือใกล้เคียงทางสรีรวิทยา คุณจึงไม่ถูกจํากัดอยู่แค่โปรตีนที่มีความบริสุทธิ์สูง วิธีนี้ช่วยให้คุณสามารถจับภาพปฏิสัมพันธ์ที่ก่อตัวขึ้นเฉพาะในสภาวะเฉพาะ เช่น การมีอยู่ของโคแฟกเตอร์ สภาพแวดล้อมของเมมเบรน หรือสัญญาณความเครียดที่เกี่ยวข้องกับโรค สําหรับ Drug Target Discovery หมายความว่าผู้สมัครของคุณจะได้รับการประเมินในบริบทที่สะท้อนถึงสิ่งที่เกิดขึ้นในร่างกายได้ดียิ่งขึ้น

•ไม่จําเป็นต้องติดฉลากโปรตีนพิเศษ

XL-MS ไม่ต้องการฉลากสารเคมีหรือแท็กพันธุกรรมที่กําหนดเองบนโปรตีนแต่ละชนิด ซึ่งช่วยลดความซับซ้อนในการทดลองหลีกเลี่ยงสิ่งประดิษฐ์ที่อาจเกิดขึ้นจากการติดแท็กและทําให้ง่ายต่อการปรับขนาดตามเป้าหมายและเงื่อนไขต่างๆ

•ไวต่อปฏิสัมพันธ์ที่อ่อนแอและชั่วคราว

เหตุการณ์ด้านกฎระเบียบที่สําคัญที่สุดบางเหตุการณ์เกี่ยวข้องกับคอมเพล็กซ์ที่มีความสัมพันธ์ต่ําหรือมีอายุสั้น นี่คือประเภทของปฏิสัมพันธ์ที่สามารถหายไปได้ด้วยเทคนิคแบบดึงลงหรือการทําให้บริสุทธิ์แบบดั้งเดิม การเชื่อมโยงข้ามจะจับภาพในขณะที่เกิดขึ้น ทําให้คุณมีเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ที่สมบูรณ์ยิ่งขึ้น และช่วยให้คุณหลีกเลี่ยงจุดบอดระหว่างการค้นพบเป้าหมายยา

เมื่อรวมกันแล้วประโยชน์เหล่านี้ช่วยให้ทีมวิจัยสามารถจัดลําดับความสําคัญของเป้าหมายได้อย่างชาญฉลาดมากขึ้น แทนที่จะมุ่งเน้นไปที่สิ่งที่วัดได้ง่าย คุณสามารถมุ่งเน้นไปที่สิ่งที่มีความหมายทางชีวภาพ – ในขณะที่ยังคงควบคุมไทม์ไลน์และงบประมาณ

(แนวทาง Ligands และ Lipidomics แบบหลายเป้าหมายสําหรับการค้นพบยา Glioblastoma)

เทคโนโลยี Longlight รองรับเวิร์กโฟลว์ XL-MS แบบ end-to-end อย่างไร

ที่ Longlight Technology เราวางตําแหน่ง XL-MS ไม่ใช่การทดลองเพียงครั้งเดียว แต่เป็นส่วนหนึ่งของโซลูชันแบบบูรณาการสําหรับการค้นพบเป้าหมายยา หลายกลุ่มไม่มีแบนด์วิดท์ภายในในการสร้างไปป์ไลน์ XL-MS เต็มรูปแบบตั้งแต่เริ่มต้น ดังนั้นเราจึงออกแบบบริการของเราเพื่อเชื่อมต่อกับกระบวนการวิจัยที่มีอยู่ของคุณ

คุณสามารถส่งตัวอย่างที่เชื่อมโยงข้ามล่วงหน้า หรือร่วมมือกับนักวิทยาศาสตร์ของเราเพื่อกําหนดกลยุทธ์การเชื่อมโยงขวางที่ปรับให้เหมาะกับระบบของคุณ โดยเลือกตัวเชื่อมขวาง เงื่อนไข และการควบคุมที่เหมาะสม จากนั้น Longlight Technology จะดูแลทุกขั้นตอนทางเทคนิค รวมถึงการย่อยตัวอย่าง การเพิ่มคุณค่าเปปไทด์แบบเชื่อมขวาง การได้มาซึ่งแมสสเปกโตรเมตรี และการวิเคราะห์ข้อมูล คุณจะได้รับรายงานที่ชัดเจนและพร้อมสําหรับโครงการ ซึ่งทําแผนที่พันธมิตรปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน ระบุไซต์ลิงก์ข้าม และกลั่นกรองข้อมูลโครงสร้างที่เกี่ยวข้องกับการตัดสินใจเป้าหมายและกลไกการกระทําของคุณมากที่สุด

นอกเหนือจาก XL-MS แล้ว Longlight Technology ยังรองรับงานต้นน้ําและปลายน้ําที่ล้อมรอบ Drug Target Discovery โซลูชันจีโนมของเรา รวมถึงการจัดลําดับรุ่นต่อไป – เครื่องมือและรีเอเจนต์ที่เกี่ยวข้อง ช่วยให้คุณระบุตัวแปรทางพันธุกรรม การเปลี่ยนแปลงการแสดงออก และองค์ประกอบด้านกฎระเบียบที่เชื่อมโยงกับวิถีของโรค เทคนิคต่างๆ เช่น ChIP-seq เชื่อมต่อโปรตีน – ปฏิสัมพันธ์ DNA กับโปรตีน – แผนที่ปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนที่สร้างโดย XL-MS ทําให้คุณมีมุมมองที่กว้างขึ้นว่าเป้าหมายอยู่ภายในการควบคุมโครมาตินและเครือข่ายการถอดความอย่างไร

เรายังมีวัสดุสิ้นเปลืองและชุดอุปกรณ์ต่างๆ เช่น ชุดสกัดกรดนิวคลีอิก ชุดเตรียมห้องสมุด เจลอะกาโรสสําเร็จรูป และหลอดพิเศษ ที่ออกแบบมาเพื่อการใช้งานในชีวิตประจําวันอย่างสม่ําเสมอในสภาพแวดล้อมการวิจัยและชีวเภสัชภัณฑ์ ภารกิจคือการลดความซับซ้อนของทุกขั้นตอน – การเตรียมการ การวัด และการวิเคราะห์ – เพื่อให้นักวิทยาศาสตร์ของคุณใช้เวลาน้อยลงในการตั้งค่าและการแก้ไขปัญหา และมีเวลามากขึ้นในการทดสอบสมมติฐานที่สําคัญ การนํา XL-MS มารวมกันสําหรับการทําแผนที่ปฏิสัมพันธ์ แพลตฟอร์มจีโนมิกส์ และเครื่องมือในห้องปฏิบัติการที่เสถียรทําให้เวิร์กโฟลว์การค้นพบเป้าหมายยาที่ประสานงานกันและมีประสิทธิภาพมากขึ้น แทนที่จะใช้การทดสอบแบบแยกส่วน คุณจะสร้างไปป์ไลน์ที่ป้อนข้อมูลที่ดีขึ้นอย่างต่อเนื่องเพื่อการตัดสินใจที่ดีขึ้น

หากองค์กรของคุณต้องการลดวงจรการค้นพบลดความเสี่ยงและรับภาพที่ชัดเจนขึ้นว่าเป้าหมายยาที่มีศักยภาพมีพฤติกรรมอย่างไรในระบบชีวภาพจริงเรายินดีที่จะสนับสนุนคุณ

สนใจสํารวจ XL-MS สําหรับโครงการ Drug Target Discovery ครั้งต่อไปของคุณหรือไม่?

ติดต่อ Longlight Technology เพื่อหารือเกี่ยวกับเป้าหมาย ตัวอย่าง หรือการออกแบบการศึกษา และให้เราช่วยคุณเปลี่ยนข้อมูลปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนที่ซับซ้อนให้เป็นข้อมูลเชิงลึกที่เป็นรูปธรรมและนําไปใช้ได้จริง